Poiché la natura del processo di filtraggio causa distorsioni a una o entrambe le estremità dei dati o del profilo. Queste distorsioni vengono rimosse in modo da inserire solo i dettagli autentici nell'analisi.
Per i filtri 2CR, i dati equivalenti a 2 lunghezze di campionamento vengono eliminati all'inizio dei dati filtrati. Per i filtri PC 2CR (con correzione di fase), viene eliminata 1 lunghezza di campionamento da ciascuna estremità dei dati filtrati.
Grazie alla minore distorsione del filtro gaussiano, viene perduta solo metà della lunghezza di campionamento a ciascuna estremità dei dati filtrati.
